Zgodnie z wytycznymi państw-darczyńców, środki finansowe dostępne w ramach Mechanizmów Finansowych mogą być wykorzystane na realizację następujacych typów projektów:

• Pojedyncze projekty  – wysokość wnioskowanej pomocy w ramach pojedynczego projektu nie może być mniejsza niż 250 000 euro
  
  Pojedyncze projekty - wersja wytycznych z lutego 2006 r.
  (pobierz plik w formacie .pdf)  
  
  
• Programy - program składa się z równorzędnych grup oddzielnych projektów skierowanych na osiągnięcie wspólnych przestrzennie/sektorowo/tematycznie celów. Programy mają na celu ułatwienie wdrażania całościowych i bardziej kosztownych strategii. 
  
  Operator programu zobowiązany jest do przedstawienia w formularzu aplikacyjnym szczegółowego i kompleksowego opisu, w szczególności dotyczącego:

1. celu/celów i założeń programu oraz sposobu jego realizacji w podziale na etapy,
   
2. typów beneficjentów programu oraz typów projektów jakie będą mogły być realizowane w ramach programu,
   
3. struktury zarządzania i wdrażania programu,
   
4. zarządzania środkami finansowymi (wypłaty ew. zaliczek, przyjmowanie wniosków o płatność, realizacja płatności),
   
5. procedury ogłaszania naboru wniosków aplikacyjnych do programu (forma publikacji, jej częstotliwość, proponowana treść ogłoszenia),
   
6. procedury oceny i wyboru projektów w ramach programu (zasady tworzenia i skład komisji/komitetu oceniającego, kryteria wyboru, rola ewentualnych partnerów programu),
   
7. procedury odwoławczej,
   
8. systemu monitorowania i raportowania, 
9. systemu kontroli finansowej i audytu,
   
10. działań promocyjno-informacyjnych.
    
    Operator programu zobowiązany jest do wniesienia wkładu finansowego, zgodnie z ogólnymi wymogami dotyczącymi współfinansowania. Wkład ten dokonywany jest niezależnie od współfinansownia przez finalnych beneficjentów (poszczególnych projektów realizowanych w ramach programu) i ma na celu stworzenie funduszu programu, którego środki finansowe będą dofinansowywały realizację poszczególnych projektów.
    
    Zważywszy na rolę operatora programu w wyborze projektów, nie może on być beneficjentem programu. W przypadku uruchamiania programu w partnerstwie z innymi podmiotami, partnerzy także nie mogą być jego beneficjentami
    
    Programy - wersja wytycznych z lutego 2006 r.
    (pobierz plik w formacie .pdf)
    
    W przypadku programów ich operatorzy są zobowiązani do przygotowania i przedstawienia - w oddzielnym załączniku do wniosku aplikacyjnego - systemu zarządzania programem. Elementy systemu zarządzania dla programu wyszczególnione są w poniższym pliku:
    System zarządzania dla programu   - informacja z 20 grudnia 2006 r.
    

Oddzielnym rodzajem projektów są granty blokowe.